İskender Ozan Toprak, 1977 yılında Aydın'ın İncirliova ilçesinde doğdu. Babası Cemal Toprak'ın teşvikiyle 5 yaşında, Anadolu'nun geleneksel enstrümanı 'bağlama' çalmayı öğrenerek müziğe başladı.
Müzik eğitimini Bolu, Abant İzzet Baysal Üniversitesi Güzel Sanatlar Fakültesi, Müzik Bölümü (keman ve piyano), ardından Ege Üniversitesi Devlet Türk Musikisi Konservatuarı, Türk Müziği Bölümü'nde tamamladı. Eğitiminin ikinci yılından itibaren Türkiye Radyo Televizyon Kurumu'nda (TRT) bağlama sanatçısı olarak çalışmaya başladı ve birçok radyo programına katıldı. Ayrıca Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Korosu ve Salihli İlçe Korosu'nda koro şefliği yaptı.
İskender Ozan geleneksel çalgılar; bağlama, yaylı tambur, mizraplı tambur, kabak kemane, balaban, kaval ve zurna ustasıdır.
2002 yılında müzikoloji üzerine çalışmalar yapmak üzere Almanya'ya taşındı.
İskender Ozan, 2010 yılında daha canlı ve çok kültürlü olan Londra'ya taşındı. Thames Festivali'nde Kraliyet Akademi Orkestrası ile billikte çaldı ve Londra'da pek çok konsere ve yerel tiyatroya katıldı.
2016 yılından beri Melbourne'da yaşayan İskender Ozan Toprak, Avustralya'nın en iyi obua virtiözlerinden biri olan Ben Opie ve ayrıca Laila Engle (flüt), Natasha Conrau (keman), Willow Stahlut (keman), Phoebe Green (viyola), Stephanie Arnold (çello), Miranda Hill (kontrbas), Alisha Brooks (saksafon) ve Murat Yücel (vurmalı çalgı) ile birlikte "Ocean Project - Okyanus Projesi"ni oluşturdu. Ocean Project'in ilk konseri 8 Nisan 2017'de Melbourne'de Penola College'da yapıldı ve seyirci tarafından büyük beğeni topladı.
Mart 2017'de dünyaca ünlü müzisyen Mercan Dede'nin Avustralya turnesine eşlik etti.
24 Nisan 2017 tarihinde İskender Ozan, Avustralya'nın en iyi salonlarından biri olan Melbourne Resital Merkezi'nde konser veren ilk Türk müzisyen oldu. Resital Merkezi konseriyle ilgili bir röportajda İskender Ozan Toprak için şunlar yazıldı:
“Iskender Ozan Toprak, klasik müzik ile geleneksel doğu müziğinin güzel bir kombinasyonunda, doğunun batı ile buluşması olarak tanımlanabilecek eşsiz bir müzik karışımı sunuyor.”
İskender Ozan, 27 Ekim 2018 tarihinde Melbourne Resital Merkezi'nin ünlü Elizabeth Murdoch Hall sahnesinde, kendi bestelerinin de seslendirildiği "Euphony - Ahenk" konserini yönetti. Türkler’in Avustralya’ya gelişinin 50. Yılı nedeniyle düzenlenen ve Yurtdışı Türkler ve Akraba Toplulukları Başkanlığı (YTB), Türk Hava Yolları ve Commonwealth Bankası sponsorluğundaki bu konsere, Mt Hira Koleji tarafından destek verildi.
21 Mart 2019'da İskender Ozan Toprak, 18 Mart Çanakkale Zaferi'nin 104. yılı dolayısıyla, T.C. Cumhurbaşkanlığı himayelerinde Ankara'da düzenlenen 'Sonsuz Ağıt Çanakkale' konserinin orkestra yönetmenliği yaptı. Genel sanat yönetmenliğini Prof. Erol Parlak ve anlatıcı metin yazarlığını Prof. İskender Pala'nın yaptığı konsere 35 müzisyen ve Erol Parlak, Elif Buse Doğan, Fındık Buse Katmış, Neşe Demir, Erhan Uslu, Servet Devran ve Yeşim Köksal olmak üzere 7 solist ve eşlik etti. Konserde seslendirilen 13 eser İskender Ozan Toprak tarafından düzenlendi.
İskender Ozan Toprak kendisinin oluşturduğu bir orkestra ile Melbourne Resital Merkezi'nde, WOMADelaide Müzik Festivali ve Port Fairy Halk Festivali gibi çeşitli yerlerde konserler düzenledi ve düzenlemeye devam etmektedir.